故事发生在圣痕之谜篇之后，在九幽深受重伤的姬子，生命处于危险之中...为了变强保护重要的人，琪亚娜参加了德丽莎设计的训练，但在这时候，逆熵开始了对圣芙蕾雅学园的入侵！